В состав муниципального образования Каптыревский сельсовет входят сельские населенные пункты: с. Каптырево (административный центр), с. Новопокровка, с. Саянск, п. Синий Камень, п. Шарып, с. Шунеры.
МО «Каптыревский сельсовет» граничит на северо-востоке – с МО «Ильичевский сельсовет», на востоке – с МО «Иджинский сельсовет», на юго-востоке – с МО «Субботинский сельсовет», на юге – с МО «Сизинский сельсовет» и на северо-западе с Алтайским районом республики Хакасия.